Den øverste myndighed er Førerstævnet
Førerstævnet er det man i andre organisationer vil kalde generalforsamlingen. Hvert forår holder Baptistspejderne Førerstævne, hvor der tages beslutninger om korpsets fremtid.
Alle medlemmer af korpset, som er fyldt 15 år, har stemmeret, når de deltager på Førerstævnet.
Korpsrådet
Det er Korpsrådet, der leder korpset mellem Førerstævnerne. Korpsrådet består af spejderchefen, vicespejderchefen, korpsrådsformanden, en korpskasserer og 6 øvrige medlemmer. Alle medlemmer af korpsrådet bliver valgt på Førerstævnet, og de er på valg hvert 2. år.
Den daglige ledelse
Forretningsudvalget leder korpset mellem Korpsrådsmøderne. Udvalget består af spejdercheferne, korpsrådsformanden og kasseren.
Korpsets administrative opgaver bliver løst af de ansatte på Korpskontoret.
Udvalg
Baptistspejdernes udvalg står for en stor del af det nationale arbejde. Et udvalg laver lederuddannelse, et andet står for kommunikation og IT-systemer, et tredje står for vedligeholdelse af vores spejdercenter.
Der er både kontinuerlige udvalg, som løser løbende opgaver og ad-hoc-udvalg, der løser afgrænsede opgaver. Læs mere om udvalg her.
Kredsene
Det lokale arbejde sker i kredsene. Her er det kredsrådet, som har ansvaret for hver enkelt kreds’ arbejde. Et kredsråd består af repræsentanter for førerne, forældrene og den lokale Baptistmeninghed. I det daglige er det kredsføreren og de øvrige førere, der står for det lokale spejderarbejde.
Nogle steder i landet er kredse gået sammen i divisioner. Divisionerne laver regionalt spejderarbejde, som giver spejderne større og flere oplevelser, end de kan få i kredsen.
Alle spejderførere, kredsråd, udvalg og korpsrådsmedlemmer arbejder frivilligt og ulønnet. Kun til løsning af de landsdækkende administrative opgaver, har Baptistspejderne lønnede ansatte.